第二天早晨，小智、皮卡丘和小豪以及樱木博士的女儿小春正在餐厅里用早餐，小春在樱木博士到来之前匆匆用完早餐就拿着书包准备去学校，她出门的时候正好和樱木博士擦肩而过。樱木博士叹了口气，目送着这个不知怎么就进入叛逆期的女儿离开研究所才转身给向给小智和小豪介绍了自己的两位助手菊菜和莲司，他还给小智一台智能手机。随后，他派出两只洛托姆，并让两只洛托姆进入小智和小豪的智能手机，使得手机变成手机洛托姆。
用过早餐，他们跟着樱木博士去了研究所内，莲司因为路上堵车而险些迟到，樱木博士向他询问原因，还没等莲司开口，菊菜就告诉了樱木博士街上塞车的原因，街上有大量的妙蛙草和妙蛙种子，于是樱木博士派遣小智和小豪前往调查。他们来到街上，君莎小姐正好在指挥交通，好让妙蛙种子们通过马路，小豪拿出自己的洛托姆手机查看妙蛙种子和妙蛙草的资料。
他们从君莎小姐那边了解到，火箭队在附近的消息，小智心里已经做好了要跟他们打一架的举动，真的有够阴魂不散的。
“会说话的喵喵什么的，都是骗人的。”小豪听到火箭队那只喵喵会说话，表示不屑。小智无奈耸肩，毕竟这种事情换个没遇到过的人都会觉得是骗人。
“砰——砰——砰。”
一个声音从巷子里传出。
“皮卡皮卡皮！”听力敏锐的皮卡丘伸出自己的小短手拍了拍小智肩膀，然后指向一个地方。
“小智，你做什么！”小豪看向突然朝后面跑去的小智连忙追了上去。
戴渔夫帽的女生从白银山下来之后就去了满金市，然后从满金市坐磁浮列车来到了关都枯叶市附近，她准备在这里转搭前往丰缘地区的船只。
“……真是的，为什么非得我亲自跑一趟。”她合上手里的笔记本无奈地叹了口气，看着不算熟悉的街道，准备找路人问问港口怎么走。
她毫无目的的走在行人通道上，偶尔看到感兴趣的东西停下脚步观望一会，确定对自己而言是有用的便买了下来，很快她就走到了十字路口，目光所及之处是一群排队走在行人通道上过马路的妙蛙种子。女生好奇的停下脚步看向那些妙蛙种子，等最后一只妙蛙种子通过马路，她思索了一会，决定暂缓自己的目的，跟随自己的好奇心跟在了那些妙蛙种子身后。
很快，他们就来到了一座正在修建的道馆附近附近，女生的目光从妙蛙种子们身上离开，看向了正在那座道馆前面的两个男孩，最终她还是压了压帽子准备转身离开这里。可还没等她离开，身后就传来了争吵的声音，很清楚就能听出来两个孩子的意见发生了争歧，随后他们面前的道馆发生了剧烈的爆炸。
“‘守住’。”身体比思维更快一步，等她反应过来时已经抛出精灵球放出了自己的搭档，保护了那两个孩子争吵的孩子，“谁。”
“既然你诚心诚意地发问了。”
“我们就大发慈悲地告诉你。”
“为了防止世界被破坏。”
“为了守护世界的和平。”
“贯彻爱与真实的邪恶！”
“可爱又迷人的反派角色！”
“武藏！”
“小次郎！”
“我们是穿梭在银河中的火箭队！”
“白洞，白色的明天在等著我们！”
“就是这样喵！”
“So~nansi”
“怎么又是你们！”小智等他们念完出场词率先开口，皮卡丘在一旁随时准备送一发‘十万伏特’给他们。
烟雾散去，热气球从被炸毁的道馆废墟之上飞向天空，热气球下的网兜里是被他们一网打尽的妙蛙种子和妙蛙草。
“每次来关都都水逆的过分。”女生叹了口气，摘下了自己帽子，走上前将两个孩子拦在了身后，“雷林，准备战斗。”
“斯蒂安小姐！”小智一眼就认出了来人。
斯蒂安无奈地看向小智，叹了口气，又把目光放到了两位火箭队的身上：“你真的可以考虑一下和他们两个一样去当宝可梦搜查官，太容易被卷入麻烦事件了。‘爆音波’。”
“皮卡丘，我们也上！‘十万伏特’！”小智指挥皮卡丘上前帮助。
“可恶啊，小鬼头，你又坏我们好事！”武藏抛出一个印有火箭队标记的紫色精灵球，“出来吧，暴鲤龙，‘冰冻牙’。”
“拜托你了，班基拉斯，‘火焰牙’。”小次郎同样也丢出了相同的精灵球。
“‘劈瓦’。”斯蒂安指挥自己的搭档攻击班基拉斯。
小次郎指挥班基拉斯反击：“躲开后用‘尖石攻击’！”
小智指挥皮卡丘攻击暴鲤龙：“皮卡丘，‘十万伏特’！”
“暴鲤龙，‘破坏死光’！”武藏指挥暴鲤龙攻击。
“飞上高空，三点钟方向，攻击。”斯蒂安指挥雷林的同时放出了自己另一个搭档，“大范围‘暴风雪’。”
小智和斯蒂安合作打跑了火箭队，合力救出了妙蛙种子和妙蛙草，而这一幕正好被小豪用洛托姆手机录制下来。
“草，草……”
“种子，种子……”
一群刚被救出来的妙蛙草和妙蛙种子正懒洋洋地趴在废墟附近晒太阳，小豪正拿着洛托姆手机拍照，小智则兴奋的看向周围闪着蓝光的妙蛙草们，这个场景让他想起了当时在妙蛙花的秘密花园里看到的场景。
“花……花……”
妙蛙草进化了，一粒粒细小的花粉随着风飘向城市，他们所在的草原，再放眼望去城市，遍地开满了鲜花。
紧随妙蛙草进化的便是妙蛙种子。
小智看着这样的场景思绪飘向了自己刚出门旅行的时候。
斯蒂安叹气，她确定面前这人绝对没有听到她刚刚说的话：“小智。”
“啊，抱歉。斯蒂安姐，你可以再重复一下刚才的话吗？”斯蒂安的声音把小智从回忆中拉回，小智难得无措的挠了挠脑袋，然后向她询问刚才她都说了些什么。
斯蒂安叹气：“我就知道。关于这个还没修建完成就惨遭破坏的道馆，我会和联盟汇报的，所以你们不必担心，毕竟这也不是你们破坏的，忙完了就早点回去休息，别总往危险的地方跑。还有，把你手机号给我，偶尔也联络一下我们，知道吗。”
“知道了！”小智点头应和，然后把自己的洛托姆手机交给了她等她存入自己的手机号。
“好了，替我和大木博士他们问好。”斯蒂安把洛托姆手机还给小智，抬手揉了揉他脑袋，“我还有事，先走了。”
“那个……斯蒂安小姐，刚刚，谢谢。”小豪向斯蒂安道谢。
斯蒂安向他们挥手：“不客气。走了。”
小智和小豪向斯蒂安道别，两个人回到研究所向樱木报告了妙蛙草和妙蛙种子大量发生的原因，他也在刚刚两位助手面前表扬了小智和小豪。
“大概就是这样，那个道馆被毁的完全看不出原样，然后那里挺适合草系宝可梦生活的，阳光很好，所以关于道馆的事情可能需要多考虑一下。”靠在码头一侧栏杆等待船只的斯蒂安正用洛托姆手机和人聊着之前发生的事情，“嗯，号码发你了……是啊，他成长的很出色了，希望有机会可以和他来一场对战，。”
“那么后续事情就由你们当地联盟处理了，保持联络。”斯蒂安抬眼看向即将出发的轮船，简单的和电话对面道别后挂断电话收好洛托姆手机登上了前往丰缘地区的渡轮。